SNPdetect полимераза
Термостабильная высокоточная ДНК-полимераза с «горячим стартом», лишена экзонуклеазной активности
SNPdetect используется для детекции однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) и специфичной амплификации фрагментов ДНК длиной до 1 000 п.о.
Основные характеристики
- Высокая точность синтеза ДНК из дезокси- и дидезоксинуклеотидов
- Высокая специфичность, низкая фоновая амплификация
- Быстрый «горячий старт» в первом цикле денатурации (95 °C)
- Температурный оптимум активности: 70–74 °C
- Отсутствует 5’→ 3’ экзонуклеазная активность и 3’→ 5’ экзонуклеазная активность (корректирующая)
- Длина амплифицируемых фрагментов до 1 т.п.о.
- Возможность клонирования продуктов ПЦР в ТA-векторы (pAL2-T или pKAN-T)
Область применения
- SNP генотипирование: аллель-специфичная ПЦР (AS-PCR), аллель-специфичное удлинение праймера (AS-PEX)
- Высокоспецифичная ПЦР, в том числе мультиплексная ПЦР
- ПЦР-РВ с изменением конформации зондов без его разрушения, например, технологии Scorpion, Amplifluor, LUX и др.
- HRM, плавление с использованием меченных и немеченных зондов
- ПЦР-РВ с интеркалирующими красителями
Аллель-специфичная ПЦР с использованием SNPdetect полимеразы.
Анализ полиморфизма в гене человека LCT (С/Т):
праймер 1 («С» на 3’-конце) – зеленые линии;
праймер 2 («Т» на 3’-конце) – красные линии.
На старте использовано 5 нг геномной ДНК, интеркалирующий краситель SYBR Green I.
SNPdetect полимеразу нельзя использовать для технологии TaqMan, где разгорание зонда происходит в результате 5’→ 3’ экзонуклеазной активности полимеразы. Для решения таких задач рекомендуется использовать HS Taq ДНК-полимеразу.
| Название | Компоненты набора | Инструкция | Кат. # | Количество | Цена, руб. |
|---|---|---|---|---|---|
| SNPdetect полимераза | 50X SNPdetect полимераза (10 ед./мкл), 100 мкл | PK022S | 200 реакций по 25 мкл | 7 000 | |
50X SNPdetect полимераза (10 ед./мкл), 500 мкл (5 х 100 мкл) | PK022L | 1 000 реакций по 25 мкл | 30 900 | ||
50X SNPdetect полимераза | PK022B | 61 800 |
* Минимальный объем полимеразы, изготавливаемый по индивидуальному заказу: 1 мл, шаг – 1 мл.
Транспортировка и хранение: –20 °С.
Срок годности: 12 месяцев с даты поставки при соблюдении условий хранения и транспортировки.
Список литературы
- Shagin DA, Shagina IA, Zaretsky AR, Barsova EV, Kelmanson IV, Lukyanov S, Chudakov DM, Shugay M.
A high-throughput assay for quantitative measurement of PCR errors.
Sci Rep. 2017 Jun 2;7(1):2718
pmid: 28578414 doi: 10.1038/s41598-017-02727-8 - Julia Stadler, Johanna Eder, Barbara Pratscher, Sabine Brandt, Doris Schneller, Robert Mullegger, Claus Vogl, Franz Trautinger, Gottfried Brem, Joerg P. Burgstaller
SNPase-ARMS qPCR: Ultrasensitive Mutation-Based Detection of Cell-Free Tumor DNA in Melanoma Patients.
PLoS One. 2015; 10(11): e0142273
pmid: 26562020
Связанные продукты
| Название | Описание | Инструкция | Кат. # | Количество | Цена, руб. |
|---|---|---|---|---|---|
| Геномная ДНК | |||||
| Геномная ДНК человека | Геномная ДНК из клеточной линии человека Raji, 100 мкг/мл. | NA101 | 10 мкг, 100 мкл | 4 000 | |
| Фрагментированная геномная ДНК человека | Фрагментированная геномная ДНК из клеточной линии человека Raji, 100 мкг/мл. | NA102 | 10 мкг, 100 мкл | 4 900 | |
| Геномная ДНК крысы | Геномная ДНК крысы из клеточной линии C6, 100 мкг/мл. | NA201 | 10 мкг, 100 мкл | 4 000 | |
| Буферы для ПЦР | |||||
| MgCl2 | Раствор MgCl2 (50 мМ) для индивидуального подбора концентрации ионов Mg2+ в реакции | PB005 | 5 мл (5 x 1 мл) | 700 | |
| 10X SNPdetect буфер (без Mg2+) | 10X буфер для полимеразы SNPdetect. Для большинства приложений, в т.ч. для проведения ПЦР-РВ с интеркалирующими красителями | PB015 | 3 мл (5 x 0.6 мл) | 700 | |
| dNTP | |||||
| Смесь dNTP (10 мМ каждого) | Смесь dNTP предназначена для использования в ПЦР, реакциях обратной транскрипции и любых других приложениях, требующих синтеза ДНК | PB006S | 200 мкл, 2 мкмоль | 850 | |
| PB006L | 2 мл (10 x 200 мкл), 20 мкмоль | 6 600 | |||
| Смесь dNTP (2 мМ каждого) | PB032 | 5 мл (5 х 1 мл), 10 мкмоль | 4 850 | ||
| Набор dNTP (100 мМ) | Набор из 4-х пробирок высокоочищенных дезоксинуклеотидов (dATP, dTTP, dGTP, dCTP). Концентрация каждого — 100 мМ | PB033 | 4 х 250 мкл, 25 мкмоль каждого | 5 500 | |
| Раствор dUTP (100 мМ) New | Для использования в ферментативных реакциях синтеза ДНК, где требуется полная или частичная замена dTTP (в том числе для контроля контаминации реакции) | PB034 | 100 мкл, 10 мкмоль | 700 | |
| Вода | |||||
| Вода деионизированная, свободная от нуклеаз | Вода высокой степени очистки | PB207S | 7.5 мл (5 х 1.5 мл) | 450 | |
| PB207M | 50 мл | 2 700 | |||
| PB207L | 1 л | 48 000 | |||
| Красители для ПЦР | |||||
| 50Х SYBR Green I для ПЦР-РВ | Готовый к применению 50Х раствор для добавления в реакционную смесь для ПЦР с детекцией в режиме реального времени (ПЦР-РВ) | PB025S | 0.1 мл, 200 реакций по 25 мкл | 1 700 | |
| PB025M | 0.5 мл (5 х 0.1 мл), 1 000 реакций по 25 мкл | 7 000 | |||