Интеркалирующий краситель SYBR Green I для ПЦР-РВ
| SYBR Green I
– интеркалирующий краситель, специфичный к двухцепочечной ДНК. Раствор оптимизирован для применения в ПЦР
с детекцией в режиме реального времени (ПЦР-РВ).
Краситель рекомендуется использовать как 50X раствор, при оптимизации условий ПЦР допускается применять в
диапазоне от 25Х до 100Х. Входящий в комплект раствор 100% DMSO можно добавлять вплоть до конечного
содержания 5%.
Оптимизация ПЦР при использовании
SYBR Green I |
Состав: SYBR Green I
в буферном растворе, pH 8.0
Спектральные свойства: длина волны возбуждения – 497 нм, флуоресценции – 521 нм
Принцип действия
SYBR Green I
– интеркалирующий краситель, интенсивность флуоресценции которого увеличивается на несколько порядков при
встраивании в двухцепочечную ДНК.
Поэтому в ходе ПЦР при накоплении продукта амплификации сигнал флуоресценции возрастает, образуя кривую сигмоидной
формы (рис. А).
Амплификация фрагмента геномной ДНК человека (200 п.о.) Использованы разведения геномной ДНК
человека с шагом в 4 раза (от 125 нг/реакцию до 7.5 пг/реакцию) А: кривые амплификации;
Б: кривые плавления ПЦР-продуктов.
| |
Поскольку
SYBR Green I
связывается с любой двухцепочечной ДНК, увеличение флуоресценции в ПЦР может быть связано с накоплением как
специфического продукта, так и неспецифического (димеры праймеров, неспецифический отжиг праймеров). В реакции без
матрицы уровень флуоресценции может превышать пороговый уровень не вследствие контаминации матрицей, а из-за
образования димеров праймеров. Для получения корректных результатов после окончания реакции необходимо
дополнительно проанализировать результат ПЦР с помощью построения так называемой "кривой плавления" (melt curve).
Анализ кривой плавления
Кривая плавления должна быть построена в диапазоне от температуры на 5–10 °C
ниже температуры плавления праймера (Tm) до температуры полной денатурации (примерно 95 °C).
Обычно кривая строится после проведения ПЦР. Анализировать кривую удобнее всего в координатах -d(RFU)/dT от t°
(обратная зависимость скорости от температуры, рис. Б).
Совместимость с приборами
SYBR Green I
совместим с любыми приборами для проведения амплификации в режиме реального времени.
Совместимость с компонентами ПЦР
50Х SYBR Green I
совместим с референсным красителем ROX, с любыми неокрашенными реакционными буферами, а также с полимеразами
любого типа, вне зависимости от наличия 5’ или 3’ экзонуклеазной активности.
50Х SYBR Green I
может использоваться в реакциях с добавлением dUTP и урацилгликозилазы.
При использовании рекомендуется применять полимеразы с "горячим стартом".
ПРОДУКТ | КАТ.# | СОСТАВ | КОЛ-ВО | ЦЕНА, РУБ. | ИНСТРУКЦИЯ (PDF) |
Цена действительна на территории РФ и не включает доставку, а также не включает затраты на оформление договора для
заказов с суммой менее 10 тысяч рублей. Продукты предназначены только для научно-исследовательских работ. Продукты
не предназначены для лечения или диагностики заболеваний.
|
50Х SYBR Green I для ПЦР-РВ | PB025S | 50Х SYBR Green I
, 0.1 мл DMSO, 1 мл
| 200 р-ций по 25 мкл | | |
PB025M | 50Х SYBR Green I
,
5 х 0.1 мл DMSO, 1 мл
| 1000 р-ций по 25 мкл | |
Число циклов замораживания/размораживания: не более 20.
Транспортировка и хранение: -20 °C в темноте.
Срок хранения: при соблюдении условий хранения и транспортировки 1 год со дня поставки.