Нанопоровое секвенирование плазмид
 | Преимущества секвенирования плазмид с использованием технологии определения последовательности ДНК третьего поколения (Nanopore):
|
Результаты
Результаты отправляются на электронную почту (в заявке можно указать несколько адресов) в виде ссылки на архив.
Для каждого образца будут переданы материалы:
- Полный сиквенс плазмиды в формате .fasta;
- График равномерности покрытия секвенирования (coverage plot) в формате .png;
- Последовательность ДНК с оценкой точности (quality scores) для каждого нуклеотида в формате .fastq;
- Отсортированные выровненные прочтения в формате .bam.
Дополнительная информация может быть предоставлена по запросу.
 Пример результатов секвенированияСкачать (zip) |
Размещение заказа
Для оформления заказа, пожалуйста, заполните online-форму и приложите к образцам распечатанную заявку (файл для печати будет доступен на финальном этапе заполнения формы. После оформления заказа заявку также можно будет скачать на странице "История заказов").
| КАТ.# | СЕРВИС | ЦЕНА, РУБ. | СРОК ВЫПОЛНЕНИЯ | |
|---|---|---|---|---|
|
Цены указаны с учетом НДС. Стоимость доставки рассчитывается отдельно. Для заказов с суммой менее 10 тыс.руб. также отдельно рассчитывается стоимость оформления договора (заключается по запросу заказчика). * Срок указан с момента запуска (выполняется 2 раза в месяц). | ||||
| NPS01 | Секвенирование плазмидной ДНК на основе технологии Nanopore | 5 000 | 5–10 рабочих дней* | |
| Дополнительные услуги | ||||
| CS043 | Наработка плазмидной ДНК, не менее 2 мкг (Miniprep) | 3 000 | +3 дня | |
| Наработка плазмидной ДНК, не менее 50 мкг (Midiprep) | 5 800 | +5–10 дней | ||
Критерии качества передаваемой плазмидной ДНК:
Для успешного выполнения работ передаваемая плазмида должна соответствовать следующим требованиям:
- Соотношение 260/280: 1.8–2.0;
- Соотношение 260/230: 2.0–2.2;
- Концентрация: 100–500 нг/мкл;
- Минимальный объем для плазмид длиной:
<30 кб — 15 мкл;
30–150 кб — 30 мкл;
>150 кб — 50 мкл. - Целостность плазмиды и отсутствие РНК должны быть оценены по электрофорезу в агарозном геле.
Перед секвенированием мы бесплатно выполняем предварительный контроль качества присланной матрицы. При обнаружении отклонений выполнение заказа приостановливается для обсуждения всех деталей и рисков.
Выделение плазмидной ДНК производится только из образцов бактериального происхождения. Вы можете предоставить бактерии в агарозной среде на чашках или других носителях. Во избежание замораживания образцов с живыми бактериями указывайте на упаковке: "Хранение: +4 °С".
Пожалуйста, обратите внимание, что мы не принимаем условно-патогенные, патогенные организмы и организмы из неизвестных источников.
Отправка образцов
Возможные способы отправки образцов:
• передать с курьером;
• принести в любой пункт выдачи/приема заказов СДЭК;
• оставить на ресепшен Евроген по рабочим дням с 9:00 до 19:00.
Подробная информация о том, как нас найти представлена по ссылке.
Для оформления курьерской отправки образцов вы можете написать нам на sequence@evrogen.ru или
самостоятельно отправить образцы через СДЭК (курьером или принести в любой пункт выдачи/приема заказов).
Отправляемые образцы утилизируются после выполнения работ и не подлежат возврату.
Ограничения метода
Несмотря на возможность прочтения сверхдлинных фрагментов, нанопоровое секвенирование имеет ограничения. В единичных случаях возможны ошибки при прохождении протяженных гомополимерных трактов и повторяющихся участков (например, одинаковых промоторов, экспрессионных кассет и т.д.).
Вниманию заказчика
В случае невозможности исполнения заказа, возникшей по вине заказчика (например, неверно предоставленной информации о нуклеотидной последовательности, присланных некачественных биологических материалах), произведенные услуги подлежат оплате в полном объеме.
Конфиденциальность
Евроген гарантирует сохранение конфиденциальности данных, полученных в процессе обсуждения и выполнения заказа.
