Набор реактивов для нормализации кДНК "Trimmer-2"
Быстрый и удобный метод удаления повторяющихся траскриптов кДНК
Получение полноразмерных библиотек кДНК с выровненными концентрациями траскриптов
Простая и легковоспроизводимая процедура
Повышение эффективности анализа транскриптома
Полная совместимость с протоколами NGS Illumina/Solexa, ABI/SOLiD и Roche/454
Нормализация кДНК — метод выравнивания концентрации различных транскриптов в образце кДНК, основанный на уникальных свойствах термостабильной дуплекс-специфической нуклеазы (ДСН) из гепатопанкреаса камчатского краба. ДСН эффективно расщепляет двухцепочечную ДНК и не активна по отношению к одноцепочечной ДНК. Нормализация позволяет существенно увеличить эффективность анализа EST и тотального секвенирования транскриптома.
Набор "Trimmer-2" предназначен для нормализации двухцепочечной кДНК, приготовленной с помощью наборов Mint kit или Mint kit-2. После нормализации образцы кДНК имеют выравненные концентрации транскриптов, по разному представленных в исходном образце, и готовы для приготовления библиотек кДНК или секвенирования, в том числе на платформах Roche/454, ABI/SOLiD и Illumina/Solexa.
Нормализованная кДНК может также быть использована для псевдо-Нозерн блота.
Метод нормализации
Для нормализации кДНК используется метод, основанный на уникальных свойствах дуплекс-специфической нуклеазы (ДСН) из гепатопанкреаса камчатского краба. ДСН термостабильна, эффективно расщепляет двухцепочечную ДНК и не активна по отношению к одноцепочечной ДНК. Метод позволяет нормализовать образцы кДНК, обогащенные полноразмерными последовательностями, без использования трудоемких и низкоэффективных стадий физического разделения.
Результат нормализации кДНК из тканей человека.
(А) результат гель-электрофореза исходных (1) и нормализованных (2) образцов кДНК. (Б) Псевдо-Нозерн блот гибридизация этих образцов с [P32]-мечеными фрагментами генов глицеролфосфатдегидрогеназы (GPDH) и убикуитина С (UBC). М – маркер 1 kb DNA Ladder; эм. – эмбриональный; тонк. киш. – тонкая кишка.
| Название | Инструкция | Кат. # | Количество | Цена, руб. |
|---|---|---|---|---|
| Набор реактивов для нормализации кДНК "Trimmer-2" | NK003 | 10 реакций | 46 800 |
Хранение: –20 °C.
Транспортировка: комнатная температура.
Срок годности: 12 месяцев с даты поставки при соблюдении условий хранения и транспортировки.