- Быстрый и удобный метод удаления повторяющихся траскриптов кДНК
- Получение полноразмерных библиотек кДНК с выровненными концентрациями траскриптов
- Простая и легковоспроизводимая процедура
- Повышение эффективности анализа транскриптома
- Полная совместимость с протоколами NGS Illumina/Solexa, ABI/SOLiD и Roche/454
Нормализация кДНК - метод выравнивания концентрации различных транскриптов в образце кДНК, основанный на уникальных свойствах термостабильной дуплекс-специфической нуклеазы (ДСН) из гепатопанкреаса камчатского краба. ДСН эффективно расщепляет двухцепочечную ДНК и не активна по отношению к одноцепочечной ДНК. Нормализация позволяет существенно увеличить эффективность анализа EST и тотального секвенирования транскриптома.
Набор "Trimmer-2" предназначен для нормализации двухцепочечной кДНК, приготовленной с помощью наборов "Набор Mint kit" или "Набор Mint kit-2" . После нормализации образцы кДНК имеют выравненные концентрации транскриптов, по разному представленных в исходном образце, и готовы для приготовления библиотек кДНК или секвенирования, в том числе на платформах Roche/454, ABI/SOLiD и Illumina/Solexa. Нормализованная кДНК может также быть использована для псевдо-Нозерн блота. |
КАТ.# | КОМПОНЕНТЫ НАБОРА | ИНСТРУКЦИЯ (PDF, англ.) | ||
---|---|---|---|---|
Цена действительна на территории РФ и не включает доставку, а также не включает затраты на оформление договора для
заказов с суммой менее 10 тысяч рублей. Продукты предназначены только для научно-исследовательских работ. Продукты
не предназначены для лечения или диагностики заболеваний.
| ||||
NK003 | Буфер для хранения ДСН, 120 мкл 4X Гибридизационный буфер, 70 мкл 2X ДСН буфер, 500 мкл ДСН стоп-раствор, 1000 мкл Контрольная плазмидная ДНК (100 нг/мкл), 20 мкл Контрольная кДНК (50-70 нг/мкл), 50 мкл Смесь праймеров GAPD (10 мкМ каждого), 25 мкл ПЦР праймер М1 (10 мкМ), 150 мкл Смесь праймеров 454 (10 мкМ каждого), 100 мкл CDS-Gsu адаптер (10 мкМ), 25 мкл CDS-4M адаптер (10 мкМ), 25 мкл |
Хранение: -20 °C.
Транспортировка: комнатная температура.
Срок годности: 12 месяцев с даты поставки при соблюдении условий хранения и транспортировки.
Метод нормализации
Для нормализации кДНК используется метод, основанный на уникальных свойствах дуплекс-специфической нуклеазы (ДСН) из гепатопанкреаса камчатского краба. ДСН термостабильна, эффективно расщепляет двухцепочечную ДНК и не активна по отношению к одноцепочечной ДНК. Метод позволяет нормализовать образцы кДНК, обогащенные полноразмерными последовательностями, без использования трудоемких и низкоэффективных стадий физического разделения.
Результат нормализации кДНК из тканей человека. (А) результат гель-электрофореза исходных (1) и нормализованных (2) образцов кДНК. (Б) Псевдо-Нозерн блот
гибридизация этих образцов с [P32]-мечеными фрагментами генов глицеролфосфатдегидрогеназы (GPDH)
и убикуитина С (UBC).
М – маркер
|