Evrogen

Инсайдер FullRAS и Инсайдер KRAS, NRAS, BRAF

Наборы реагентов для скрининга мутаций в "горячих точках" генов BRAF, NRAS и KRAS методом мутационно-специфической ПЦР-РВ

Гены KRAS, NRAS и BRAF человека кодируют ферменты-компоненты сигнального каскада RTK-RAS-RAF-MEK, регулирующего пролиферацию и дифференцировку клеток. Мутации в "горячих точках" экзонов 2 (c.12, c.13), 3 (c.59, c.61), 4 (c.117, c.146) генов NRAS и KRAS и мутация в экзоне 15 (c.600; мутация V600) гена BRAF приводят к гиперактивации белков, из-за чего происходит формирование и малигнизация опухолей. Наиболее часто вышеперечисленные мутации встречаются при колоректальном раке, меланоме, аденокарциноме легких, глиобластоме и аденокарциноме поджелудочной железы с прогностической значимостью. Помимо роли в канцерогенезе описанные мутации ассоциированы с чувствительностью опухолей к терапевтическим препаратам - анти-EGFR антителам, ингибиторам MEK1, ингибиторам BRAF.

Варианты наборов и определяемые мутации

  • Инсайдер FullRAS - экзон 2 (c.12, c.13), 3 (c.59, c.61), 4 (c.117, c.146) генов NRAS и KRAS, экзон 15 (c.600) гена BRAF
  • Инсайдер KRAS - экзон 2 (c.12, c.13), 3 (c.59, c.61), 4 (c.117, c.146) гена KRAS
  • Инсайдер NRAS - экзон 2 (c.12, c.13), 3 (c.59, c.61), 4 (c.117, c.146) гена NRAS
  • Инсайдер BRAF - экзон 15 (c.600) гена BRAF

Перечень 65 наиболее значимых мутаций в «горячих точках» экзона 15 гена BRAF и экзонов 2,3,4 генов NRAS и KRAS, выявляемых набором реагентов (список мутаций валидирован, возможно выявление других редко встречающихся мутаций).

Перечень 65 наиболее значимых мутаций в «горячих точках» экзона 15 гена BRAF и экзонов 2,3,4 генов NRAS и KRAS

Ген, экзон, координаты региона (по сборке GRCh38/hg38)

Нуклеотидная замена

Аминокислотная замена

KRAS ex2 c.12
chr12:25245343-25245355

c.35G>A

p.G12D

c.35G>T

p.G12V

c.34G>T

p.G12C

c.35G>C

p.G12A

c.34G>A

p.G12S

c.34G>C

p.G12R

c.36T>C

p.G12G

c.36T>A

p.G12G

c.36T>G

p.G12G

KRAS ex2 c.13
chr12:25245343-25245355

c.38G>A

p.G13D

c.37G>T

p.G13C

c.37G>A

p.G13S

c.37G>C

p.G13R

c.38G>C

p.G13A

c.38G>T

p.G13V

c.39C>A

p.G13G

c.39C>T

p.G13G

c.39C>G

p.G13G

KRAS ex3 c.59
chr12:25227339-25227351

c.175G>A

p.A59T

c.176C>G

p.A59G

KRAS ex3 c.61
chr12:25227339-25227351

c.183A>C

p.Q61H

c.182A>G

p.Q61R

c.182A>T

p.Q61L

c.183A>T

p.Q61H

c.181C>A

p.Q61K

c.182A>C

p.Q61P

KRAS ex4 c.117
chr12:25225705-25225721

c.351A>T

p.K117N

c.351A>C

p.K117N

c.349A>G

p.K117E

c.350A>G

p.K117R

KRAS ex4 c.146
chr12:25225622-25225635

c.436G>A

p.A146T

c.437C>T

p.A146V

c.436G>C

p.A146P

c.436G>T

p.A146S

NRAS ex2 c.12
chr1:114716119-114716131

c.35G>A

p.G12D

c.34G>A

p.G12S

c.34G>T

p.G12C

c.35G>T

p.G12V

c.35G>C

p.G12A

c.34G>C

p.G12R

c.36T>C

p.G12G

NRAS ex2 c.13
chr1:114716119-114716131

c.38G>A

p.G13D

c.37G>C

p.G13R

c.38G>T

p.G13V

c.37G>T

p.G13C

c.37G>A

p.G13S

c.38G>C

p.G13A

c.39T>C

p.G13G

NRAS ex3 c.59
chr1:114713918-114713906

c.175G>A

p.A59T

c.176C>A

p.A59D

NRAS ex3 c.61
chr1:114713918-114713906

c.182A>G

p.Q61R

c.181C>A

p.Q61K

c.182A>T

p.Q61L

c.183A>T

p.Q61H

c.183A>C

p.Q61H

c.182A>C

p.Q61P

c.181C>G

p.Q61E

NRAS ex4 c.117
chr1:114709676-114709663

c.351G>C

p.K117N

c.351G>T

p.K117N

NRAS ex4 c.146
chr1:114709587-114709576

c.436G>A

p.A146T

c.437C>T

p.A146V

BRAF ex15 c.600
chr7:140753329-140753343

c.1799T>A

p.V600E

c.1798_1799GT>AA

p.V600K

c.1798_1799GT>AG

p.V600R

c.1799_1800TG>AA

p.V600E

Основные характеристики

  • Биологический материал: ДНК, выделенная из FFPE-блоков (для выделения можно воспользоваться набором ЭкстрактДНК FFPE или аналогом).
  • Обогащение образца фрагментами ДНК, содержащими мутации, для секвенирования по методу Сэнгера.
  • Предел обнаружения – от 150 копий мутантной ДНК.
  • Автоматический анализ результатов с помощью ПО Инсайдер FullRAS.
  • Совместимость с приборами: CFX96 Touch Real-Time PCR Detection System (Bio-Rad) и 7500 Real-Time PCR Systems (Applied Biosystems).
RUO

Только для применения в научно-исследовательских целях.
Не для применения в медицине или ветеринарии.

Совместимость с приборами

  • CFX96 Touch Real-Time PCR Detection System (Bio-Rad).
  • 7500 Real-Time PCR Systems (Applied Biosystems).

Программное обеспечение (ПО)

Скачать (zip)

Инструкция к ПО

Скачать (pdf)
НазваниеАнализируемые мутацииИнструкцияКат. #Количество образцовЦена, руб.
Инсайдер FullRAS

BRAF экзон 15
KRAS экзоны 2,3,4
NRAS экзоны 2,3,4

PDFR3002

От 13 до 55*

132 700
Инсайдер KRAS

KRAS экзоны 2,3,4

PDFR3009

От 20 до 75*

62 900
Инсайдер NRAS

NRAS экзоны 2,3,4

PDFR3010

От 20 до 75*

62 900
Инсайдер BRAF

BRAF экзон 15

PDFR3011

От 20 до 88*

62 900

* Количество анализируемых образцов зависит от формата постановки реакции. Максимальное количество достигается при полной загрузке амплификатора.

Задать вопрос или заказать: order@evrogen.ru