Секвенирование генома SARS-CoV-2
 | Услуга включает
|
Материалы, предоставляемые заказчиком
кДНК генома коронавируса
Протокол cинтеза с помощью ревертазы Mint
и случайных 10-нуклеотидных праймеров (pdf)
Описание работ
Подготовка библиотек включает этап обогащения последовательностями генома SARS-CoV-2 методом мультиплексной
амплификации
со специфичных праймеров, что позволяет получить результат даже при низком содержании вирусного
генома в исходных образцах.
Библиотеки секвенируются на Illumina MiSeq в формате двусторонних чтений 2х150 п.о. со средним покрытием 200-500Х.
В ходе биоинформатического анализа полученные данные фильтруются и выравниваются на референсный геном.
Результат работы
- FASTQ файлы с чтениями;
- чтения, картированные на референсную последовательность;
- таблица с найденными вариантами;
- консенсусная последовательность генома изолята SARS-CoV-2;
- отчет о секвенировании.
Покрытие генома зависит от качества исходного биоматериала
 | Покрытие генома коронавируса, исходный материал – синтетическая РНК высокого качества.98 % генома с покрытием более 10Х. Голубым цветом представлена последовательность референсного генома коронавируса. Оранжевым – глубина покрытия. |
 | Покрытие генома коронавируса, выделенных из разного биоматериала.Цифрами показан % генома с покрытием более 10Х. Голубым цветом представлена последовательность референсного генома коронавируса. Оранжевым – глубина покрытия. |
| СЕРВИС | ЦЕНА, РУБ. | СРОК | |||
|---|---|---|---|---|---|
| Секвенирование генома вируса SARS-CoV-2 на платформе Illumina. Биоинформатический анализ полученных данных. | по запросу | 4-6 недель | |||
Полный прайс-лист на услуги NGS
Как заказать
Срок выполнения
В таблицах указан стандартный срок выполнения заказов. Гарантированный срок сдачи работ может превышать
стандартный на 1-2 недели и зависит от качества и природы исходных материалов, а также от необходимости
проведения дополнительных процедур.
Полная стоимость заказа рассчитывается с учетом дополнительных работ и оформляется в виде спецификации,
содержащей все детали заказа.
Производительность
В таблицах указан обычный выход для сбалансированного по нуклеотидному составу образца, практические выходы зависят от структуры библиотек и могут отличаться от заявленных.
Конфиденциальность
Евроген гарантирует сохранение конфиденциальности данных, полученных в процессе выполнения и обсуждения заказа.
