Секвенирование нового поколения (NGS)
 | NGS – это высокоточный и быстрый анализ больших объемов последовательностей ДНК, который позволяет изучать полные геномы, метагеномы, транскриптомы, экзомы, отдельные гены/локусы, малые РНК, ампликоны, получать данные ChIP-seq. Мы предлагаем:
- NGS на платформе Illumina: NovaSeq 6000 и MiSeq; |
Готовые решения
Анализ дифференциальной экспрессии 12 образцов
Используется для оценки и сравнения профилей экспрессии генов.
Оптимальное решение для анализа транскриптомов,
сопоставимых по размеру с человеческим.
Подготовка библиотек: обогащение поли(А+) фракции тотальной РНК, синтез кДНК по технологии RNA-seq (с рассеянной
затравки), подготовка кДНК для секвенаторов, совместимых с TruSeq (Illumina).
| ПРИБОР | ДЛИНА ЧТЕНИЯ | ПРОИЗВОДИТЕЛЬНОСТЬ | ПРОБОПОДГОТОВКА | ЦЕНА, РУБ. | СРОК |
|---|---|---|---|---|---|
| NovaSeq 6000 ячейка SP | 1 x 100 п.о. | > 30 млн чтений на образец | Не включена (готовые библиотеки) | по запросу | 4 недели |
| Включена в стоимость | по запросу | 6 недель | |||
Глубокий анализ транскриптома 6 образцов
Поиск редких транскриптов, анализ сплайс-вариантов, анализ регуляторных РНК и т.д.
Оптимальное решение для транскриптомов, сопоставимых по размеру с человеческим.
Подготовка библиотек: удаление
фракции рРНК, синтез кДНК по технологии RNA-seq (с рассеянной затравки), подготовка кДНК для секвенаторов,
совместимых с TruSeq (Illumina).
| ПРИБОР | ДЛИНА ЧТЕНИЯ | ПРОИЗВОДИТЕЛЬНОСТЬ | ПРОБОПОДГОТОВКА | ЦЕНА, РУБ. | СРОК |
|---|---|---|---|---|---|
| NovaSeq 6000 ячейка SP | 2 x 150 п.о. | > 100 млн чтений на образец | Не включена (готовые библиотеки) | по запросу | 4 недели |
| Включена в стоимость | по запросу | 6 недель | |||
Анализ метагенома (вариабельные участки 16S/ITS)
Применяется для исследования генетического состава сложных микробиологических сообществ.
Подготовка библиотек: амплификация вариабельных участков, добавление адаптеров Illumina.
| ПРИБОР | ДЛИНА ЧТЕНИЯ | ПРОИЗВОДИТЕЛЬНОСТЬ | ПРОБОПОДГОТОВКА (КОЛ-ВО ОБРАЗЦОВ) | ЦЕНА, РУБ. | СРОК |
|---|---|---|---|---|---|
| MiSeq v2 | 2 x 250 п.о. | ~16 млн чтений | 20 | 360 000 | 7 недель |
| 100 | 500 000 | ||||
| 200 | 620 000 | ||||
| MiSeq v3 | 2 x 300 п.о. | ~16 млн чтений | 20 | 460 000 | |
| 100 | 600 000 | ||||
| 200 | 720 000 | ||||
Формат выдачи данных
- FASTQ - отдельные файлы для каждого образца;
- Отчёт о качестве и количестве полученной информации;
- Доступ к файлам через защищенное хранилище Евроген.
Биоинформатический анализ данных - по запросу.
Срок выполнения
В таблицах указан стандартный срок выполнения заказов. Гарантированный срок сдачи работ может превышать
стандартный на 1-2 недели и зависит от качества и природы исходных материалов, а также от необходимости
проведения дополнительных процедур.
Полная стоимость заказа рассчитывается с учетом дополнительных работ и оформляется в виде спецификации,
содержащей все детали заказа.
Производительность
В таблицах указан обычный выход для сбалансированного по нуклеотидному составу образца, практические выходы зависят от структуры библиотек и могут отличаться от заявленных.
Конфиденциальность
Евроген гарантирует сохранение конфиденциальности данных, полученных в процессе выполнения и обсуждения заказа.
