|
|
Секвенирование следующего поколения (NGS)
|
Евроген предоставляет доступ к новейшим технологиям секвенирования следующего поколения (next-generation sequencing) на платформе Illumina, что позволяет нам предложить оптимальное решение для большинства современных задач, связанных с получением больших массивов информации о нуклеотидных последовательностях, в том числе:
- полногеномное секвенирование
- секвенирование транскриптомов (RNA-seq)
- массированное секвенирование ампликонов
- секвенирование малых РНК
- глубокое секвенирование отдельных генов или наборов генов
- секвенирование фрагментов ДНК выделенных методом иммунопреципитации хроматина (ChIP-seq)
|
Выбор подходящей технологии, объёмов и параметров секвенирования – важнейшая часть в планировании эксперимента. Исходя из целей эксперимента, мы предложим наиболее подходящую конфигурацию, позволяющую получить качественные данные при оптимальных расходах.
С чего начать?
Опишите свой проект в свободной форме и отправьте нам по электронной почте на адрес ngs@evrogen.ru. Вместе с вами мы разработаем оптимальную стратегию для решения поставленной задачи, включающую дизайн эксперимента, подготовку образцов, параметры секвенирования и анализ результатов.
Евроген обладает многолетним опытом выполнения молекулярно-биологических сервисов на заказ, включая оптимизацию образцов ДНК для высокопроизводительного секвенирования. Мы готовы обеспечить сопровождение проекта на всех этапах: от подготовки образцов до биоинформатической обработки результатов.
Если Вы планируете самостоятельно анализировать данные, результаты секвенирования будут доступны для скачивания с нашего сервера в виде исходных файлов с секвенатора в формате, определённом производителем, а также отчёта о качестве и количестве полученной информации.
Цены на наиболее востребованные параметры секвенирования:
| ПРИБОР | ДЛИНА ЧТЕНИЯ | ОБЪЁМ СЕКВЕНИРОВАНИЯ | ЦЕНА, РУБ. | СРОК ВЫПОЛНЕНИЯ |
|---|
* Обычный выход для сбалансированного по нуклеотидному составу образца, практические выходы зависят от структуры библиотек и могут отличаться от заявленных.
Окончательная цена и сроки выполнения услуги зависят от объема и метода секвенирования, а также необходимости дополнительных работ по выделению нуклеиновых кислот из биологического материала и необходимости обработки ДНК или кДНК перед секвенированием (синтез кДНК, нормализация, вычитающая гибридизация и т.д.). Эти параметры будут определены после уточнения всех деталей заказа.
|
HiSeq4000
|
1 x 50 п.о. (одностороннее) |
1 дорожка (300-400 млн чтений*) |
168 000 |
4-8 недель |
| 2 x 50 п.о. (двустороннее) |
1 дорожка (600-800 млн чтений*) |
238 000 |
| 1 x 100 п.о. (одностороннее) |
1 дорожка (300-400 млн чтений*) |
198 000 |
| 2 x 100 п.о. (двустороннее) |
1 дорожка (600-800 млн чтений*) |
298 000 |
| 2 x 150 п.о. (двустороннее) |
1 дорожка (600-800 млн чтений*) |
328 000 |
| MiSeq |
2 x 150 п.о. (двустороннее) |
1 запуск (20-40 млн чтений*) |
198 000 |
2-4 недели |
| 2 x 250 п.о. (двустороннее) |
1 запуск (20-40 млн чтений*) |
208 000 |
| 2 x 300 п.о. (двустороннее) |
1 запуск (25-50 млн чтений*) |
268 000 |
| Дополнительные услуги |
|---|
| Подготовка геномной ДНК (shotgun) для секвенаторов, совместимых с TruSeq (Illumina) |
22 000 |
 |
Удаление избытка рибосомальной РНК. Синтез кДНК по технологии RNA-seq (с рассеянной затравки).
Подготовка кДНК для секвенаторов, совместимых с TruSeq (Illumina). |
35 000 |
|
Обогащение по поли(А+) фракции. Синтез кДНК по технологии RNA-seq (с рассеянной затравки).
Подготовка кДНК для секвенаторов, совместимых с TruSeq (Illumina). |
24 000 |
|
| Подготовка библиотеки малых РНК для секвенаторов, совместимых с TruSeq (Illumina). |
30 000 |
|
Конфиденциальность
Евроген гарантирует сохранение конфиденциальности данных, полученных в процессе выполнения и обсуждения заказа.
|
