Набор реактивов для нормализации кДНК "Trimmer-2"

- Быстрый и удобный метод удаления повторяющихся траскриптов кДНК
- Получение полноразмерных библиотек кДНК с выровненными концентрациями траскриптов
- Простая и легковоспроизводимая процедура
- Повышение эффективности анализа транскриптома
- Полная совместимость с протоколами NGS Illumina/Solexa, ABI/SOLiD и Roche/454

Нормализация кДНК - метод выравнивания концентрации различных транскриптов в образце кДНК, основанный на уникальных свойствах термостабильной дуплекс-специфической нуклеазы (ДСН) из гепатопанкреаса камчатского краба. ДСН эффективно расщепляет двухцепочечную ДНК и не активна по отношению к одноцепочечной ДНК. Нормализация позволяет существенно увеличить эффективность анализа EST и тотального секвенирования транскриптома.

- Цитирование

Набор "Trimmer-2" предназначен для нормализации двухцепочечной кДНК, приготовленной с помощью наборов "Mint" или "Mint-2" . После нормализации образцы кДНК имеют выравненные концентрации транскриптов, по разному представленных в исходном образце, и готовы для приготовления библиотек кДНК или секвенирования, в том числе на платформах Roche/454, ABI/SOLiD и Illumina/Solexa.

Нормализованная кДНК может также быть использована для псевдо-Нозерн блота.

КАТ.# КОЛ-ВО КОМПОНЕНТЫ НАБОРА ЦЕНА, РУБ. ИНСТРУКЦИЯ (PDF, англ.)
Цена действительна на территории РФ и не включает доставку, а также не включает затраты на оформление договора для заказов с суммой менее 10 тысяч рублей. Продукты предназначены только для научно-исследовательских работ. Продукты не предназначены для лечения или диагностики заболеваний.
NK003 На 10 р-ций Лиофилизированная дуплекс-специфическая нуклеаза (ДСН), 50 ед.
Буфер для хранения ДСН, 120 мкл
4X Гибридизационный буфер, 70 мкл
2X ДСН буфер, 500 мкл
ДСН стоп-раствор, 1000 мкл
Контрольная плазмидная ДНК (100 нг/мкл), 20 мкл
Контрольная кДНК (50-70 нг/мкл), 50 мкл
Смесь праймеров GAPD (10 мкМ каждого), 25 мкл
ПЦР праймер М1 (10 мкМ), 150 мкл
Смесь праймеров 454 (10 мкМ каждого), 100 мкл
CDS-Gsu адаптер (10 мкМ), 25 мкл
CDS-4M адаптер (10 мкМ), 25 мкл

Хранение: -20 °C.
Транспортировка: комнатная температура.
Срок хранения: при соблюдении условий хранения и транспортировки 1 год со дня поставки.

Метод нормализации

Для нормализации кДНК используется метод, основанный на уникальных свойствах дуплекс-специфической нуклеазы (ДСН) из гепатопанкреаса камчатского краба. ДСН термостабильна, эффективно расщепляет двухцепочечную ДНК и не активна по отношению к одноцепочечной ДНК. Метод позволяет нормализовать образцы кДНК, обогащенные полноразмерными последовательностями, без использования трудоемких и низкоэффективных стадий физического разделения.

Результат нормализации кДНК из тканей человека.

(А) результат гель-электрофореза исходных (1) и нормализованных (2) образцов кДНК. (Б) Псевдо-Нозерн блот гибридизация этих образцов с [P32]-мечеными фрагментами генов глицеролфосфатдегидрогеназы (GPDH) и убикуитина С (UBC). М – маркер 1 kb DNA Ladder; эм. – эмбриональный; тонк. киш. – тонкая кишка.